617353

    Стефанов, В. Е.
    Биоинформатика [] : учебник для академического бакалавриата : учебник для студентов высших учебных заведений, обучающихся по техническим и естественнонаучным направлениям / В. Е. Стефанов, А. А. Тулуб, Г. Р. Мавропуло-Столяренко. - Москва : Юрайт, 2017. - 252 с. : рис., табл. - (Бакалавр. Академический курс). - Библиогр.: с. 252 (6 назв.). - ISBN 978-5-534-00860-9 : 59.50 р.
Книга доступна в электронной библиотечной системе biblio-online.ru. Приложение: с. 247-251
    Содержание:
ПРЕДМЕТ БИОИНФОРМАТИКИ . - С .10
МАКРОМОЛЕКУЛЫ - НОСИТЕЛИ ИНФОРМАЦИИ В КЛЕТКЕ . - С .10
Информация на клеточном уровне . - С .10-13
Структура ДНК. Азотистые основания . - С .13-18
Структура РНК . - С .18-19
Структура белков . - С .20-26
ИНФОРМАЦИОННЫЕ МАТРИЧНЫЕ ПРОЦЕССЫ НА МОЛЕКУЛЯРНОМ УРОВНЕ . - С .26
Репликация . - С .26-29
Транскрипция . - С .29-32
Процессы модификации РНК. Сплайсинг . - С .32-34
Трансляция . - С .34-37
Формирование пространственных структур ДНК. Структура ДНК-белковых комплексов . - С .37-43
Формирование пространственных структур РНК . - С .43-48
Формирование пространственных структур белков . - С .48-52
МЕЖДИСЦИПЛИНАРНЫЙ ХАРАКТЕР БИОИНФОРМАТИКИ . - С .53
Задачи биоинформатики . - С .54-55
Геномика . - С .55-56
Протеомика . - С .56-57
Молекулярная филогения . - С .57-58
МАТЕМАТИЧЕСКИЙ АППАРАТ БИОИНФОРМАТИКИ . - С .60
ПРОСТЫЕ СТАТИСТИЧЕСКИЕ МОДЕЛИ В БИОИНФОРМАТИКЕ . - С .60
Метод скользящего окна . - С .60-62
Применение теоретико-информационного подхода . - С .62-65
АЛГОРИТМЫ ВЫРАВНИВАНИЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ . - С .65-66
Алгоритм глобального выравнивания последовательностей . - С .66-69
Алгоритм локального выравнивания последовательностей . - С .69-70
Варианты реализации штрафующей функции за пропуски в выравнивании . - С .71-72
Алгоритмы множественного выравнивания последовательностей . - С .72-74
МАРКОВСКИЕ ЦЕПИ И СКРЫТЫЕ МОДЕЛИ МАРКОВА . - С .74
Марковские цепи . - С .74-76
Скрытые модели Маркова . - С .76-78
Алгоритмы, применяемые при работе со скрытыми моделями Маркова . - С .78-83
ИСКУССТВЕННЫЕ НЕЙРОННЫЕ СЕТИ . - С .83
Одиночный нейрон . - С .84-86
Обучение нейрона . - С .86-88
Иерархические сети, многослойный пецептрон . - С .88-89
Сеть Хопфилда . - С .89-91
Самоорганизующиеся карты . - С .91-93
БАЙЕСОВА СТАТИСТИКА . - С .93
Классическая и байесова вероятности. Байесов вывод . - С .93-95
Формула Байеса для непрерывных распределений . - С .96
СИМУЛЯЦИЯ МОНТЕ-КАРЛО И АЛГОРИТМЫ ИМИТАЦИИ ОТЖИГА . - С .97
Симуляция Монте-Карло . - С .97-99
Методы Монте-Карло, использующие марковские цепи . - С .99-101
Алгоритм имитации отжига . - С .101-103
ЭВОЛЮЦИОННЫЕ И ГЕНЕТИЧЕСКИЕ АЛГОРИТМЫ . - С .103
Общие принципы . - С .103
Эволюционные алгоритмы . - С .103-104
Чередование поколений в эволюционных алгоритмах . - С .104-105
Оценка и ранжирование особей согласно степени их "приспособленности" . - С .105-107
Способы отбора особей . - С .107-110
Воспроизводство особей . - С .110-111
Генетические алгоритмы . - С .111-112
АЛГОРИТМЫ КЛАСТЕРНОГО АНАЛИЗА . - С .112
Введение в кластерный анализ . - С .112-116
Примеры алгоритмов . - С .116-118
ПРИМЕРЫ МОДЕЛЕЙ В БИОИНФОРМАТИКЕ . - С .119
ОБЩИЕ МОДЕЛИ . - С .119
Сравнение последовательностей биологических полимеров . - С .119-127
Методы быстрого поиска в базах данных . - С .127-129
Статистическая оценка значимости значений оценочной функции при выравнивании последовательностей . - С .129-137
Применение скрытых моделей Маркова для идентификации последовательностей . - С .137-140
Представление входных данных и интерпретация результатов в моделях, основанных на искусственных нейронных сетях . - С .140-142
Логотипы последовательностей. Информационнотеоретическая интерпретация консервативных участков последовательностей биологических полимеров . - С .142-144
ГЕНОМИКА - ПРИМЕРЫ МОДЕЛЕЙ . - С .144
Поиск открытых рамок считывания. Поиск кодирующих фрагментов . - С .144-148
Предсказание оперонной структуры прокариотических геномов . - С .148-151
Предсказание вторичной структуры молекул РНК . - С .151-156
ПРОТЕОМИКА - ПРИМЕРЫ МОДЕЛЕЙ . - С .156
Профили аминокислотных последовательностей, позиционно-зависимые матрицы замещения . - С .156-158
Предсказание наличия сигнальных пептидов в исследуемой последовательности . - С .158-161
Применение сети Кохонена для ускорения поиска в базе . - С .161-162
Предсказание вторичной структуры белков . - С .162-168
Предсказание трансмембранных фрагментов белков . - С .168-170
МОДЕЛИРОВАНИЕ СТРУКТУРЫ БЕЛКА В СВЕТЕ ИНФОРМАЦИОННЫХ ТЕХНОЛОГИЙ . - С .170-173
Подходы к решению проблемы моделирования пространственной структуры белка. Задача сравнительного моделирования структуры белка по его аминокислотной последовательности . - С .173-180
Альтернативные способы подбора матричной структуры . - С .180-188
ЭВОЛЮЦИОННЫЕ МОДЕЛИ . - С .188-189
Множественные выравнивания . - С .189-191
Построение филогенетических деревьев . - С .191-195
БИОЛОГИЧЕСКИЕ БАЗЫ ДАННЫХ . - С .197
Основы структур баз данных . - С .197-198
Базы данных, содержащие информацию о биологических структурах и последовательностях . - С .198-202
Основные форматы данных биоинформатики . - С .202-203
Каталог известных баз данных . - С .203-207
БИОИНФОРМАТИЧЕСКИЕ ПРОГРАММЫ И СЕРВИСЫ . - С .208
Анализ последовательностей биологических полимеров . - С .208-211
Расширенный поиск с применением алгоритмов семейства BLAST . - С .211-214
Предсказание физико-химических свойств белков на основании аминокислотных последовательностей . - С .214-215
Поиск белков, обладающих сходными физико-химическими свойствами . - С .215-216
Предсказание особых типов структур и свойств белков . - С .216-219
Каталог репозиториев веб-сервисов . - С .219-220
КВАНТОВЫЙ МИР И БИОЛОГИЯ - ДВЕ СУЩНОСТИ ОДНОЙ И ТОЙ ЖЕ РЕАЛЬНОСТИ . - С .222
ИНФОРМАЦИЯ И ВЫЧИСЛЕНИЯ: ОТ КЛАССИЧЕСКОГО КОМПЬЮТИНГА К КВАНТОВОМУ . - С .222
Что представляет собой информация - попытка определения . - С .222-223
Классическая информация и вычисления . - С .223-224
Квантовая информация и вычисления . - С .224-229
СОЗНАНИЕ КАК ПРОЯВЛЕНИЕ КВАНТОВОГО МИРА И ЧЕЛОВЕЧЕСКИЙ МОЗГ В КАЧЕСТВЕ КВАНТОВОГО КОМПЬЮТЕРА . - С .229
Квантовая информация и работа сознания находят друг друга . - С .229-233
Одна проблема: как совместить локальность и нелокальность . - С .233
Пути преодоления противоречий. Грани нелинейности: логика, множества, числа . - С .233-234
Фрактальная р-адическая феноменология единства естественных систем . - С .234-235
Р-адическая система разбирается не только в работе сознания, но и в конформациях белков . - С .235-237
СПИН - НОСИТЕЛЬ КВАНТОВОЙ ИНФОРМАЦИИ . - С .237
Квантовый спин и фаза . - С .237-238
Триплетные и синглетные состояния . - С .238-241
Спин заставляет спирали ДНК закручиваться в спираль . - С .241-244
УДК

Кл.слова (ненормированные):
БИОИНФОРМАТИКА -- ИНФОРМАТИКА -- МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОЛОГИЯ -- БИОЛОГИЯ -- РЕПЛИКАЦИЯ -- РЕПРОДУКЦИЯ -- ТРАНСКРИПЦИЯ -- ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ -- ГЕНОМИКА -- МАТЕМАТИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ -- МЕТОДЫ -- МОДЕЛИ -- БАЗЫ ДАННЫХ -- ИНФОРМАЦИОННОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ -- ПРОГРАММНОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ -- МАТЕМАТИЧЕСКОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ -- УЧЕБНЫЕ ПОСОБИЯ -- ВИДЫ ДОКУМЕНТОВ
Аннотация: Приведены основы биоинформатики - науки, изучающей живые системы методом компьютерного эксперимента. Объем курса соответствует уровню академического бакалавриата, а четкое структурирование информации и обоснованный выбор разделов, описывающих ключевые концепции базовых дисциплин - молекулярной биологии, математики, квантовой физики, - делает книгу полезной для широкого круга читателей разного уровня подготовки и специализации. Содержит описания реальных и общедоступных ресурсов биологических баз данных и репозиториев биоинформатических инструментов.


Доп.точки доступа:
Тулуб, А. А.; Мавропуло-Столяренко, Г. Р.
Экземпляры всего: 1
ОКД/57/617353 (1)
Свободны: ОКД/57/617353 (1)