М 75 Молекулярно-генетический анализ вирусоподобных элементов в геноме хвойных / И. Э. Рубель [и др.] // Труды БГТУ. Серия 1, Лесное хозяйство, природопользование и переработка возобновляемых ресурсов : научный журнал. - 2017. - № 1(192). - С. 39-43. - Библиогр. в конце ст. . - ISSN 2519-402X
Кл.слова (ненормированные): ХВОЙНЫЕ ПОРОДЫ -- ЛЕСНЫЕ ПОРОДЫ -- ПОДВИЖНЫЕ ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ЭЛЕМЕНТЫ -- НУКЛЕОТИДНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ -- СЕКВЕНИРОВАНИЕ -- БИОХИМИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ -- МЕТОДЫ -- МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ -- ГЕНОМЫ -- ВИРУСЫ РАСТЕНИЙ -- ФИТОПАТОГЕНЫ -- РОССИЯ -- СНГ Аннотация: Описывается разнообразие вирусоподобных генетических элементов хвойных. Данные для последующего анализа и поиска вирусоподобных последовательностей в растительном номе были получены в результате высокопроизводительного секвенирования на основе полупроводниковой детекции протонов (технология Ion Torrent). Приведены общие сведения о схеме секвенирования по этой технологии. В качестве исходного материала использовались геномные и транскриптомные ДНК- и кДНК-библиотеки сосны обыкновенной и ели европейской. Поиск среди полученных протяженных последовательностей проводился путем сопоставления с записями базы данных GenBank (National Center for Biotechnological Information - NCBI), с использованием онлайн-программы BLAST, Был аннотирован ряд последовательностей, имеющих сходство с ранее описанными вирусоподобными генетическими элементами. Среди них - ретротранспозоны групп ТуЗ/gypsy и Ty1/copia, содержащие длинные концевые повторы (LTR) и широко встречающиеся в геноме ели, a также ретротранспозоны, не содержащие LTR и относящиеся к семейству LINE. При этом все обнаруженные последовательности были уникальными, а большая их часть содержала последовательности различных генов первичного и вторичного метаболизма хвойных, что может косвенно свидетельствовать об их роли в формировании адаптивной изменчивости растений. Доп.точки доступа: Рубель, И. Э.; Баранов, О. Ю.; Пантелеев, С. В.; Разумова, О. А.; Гущин, В. А.; Макаров, В. В. Имеются экземпляры в отделах: всего 1 : ХР (1) Свободны: ХР (1) |