Поиск и идентификация мобильных генетических элементов в геноме хвойных растений с использованием метода высокопроизводительного секвенирования [] / И. Э. Рубель [и др.] // Проблемы лесоведения и лесоводства : сборник научных трудов / Национальная академия наук Беларуси, Институт леса. - Гомель, 2016. - Вып. 76. - С. 250-256 : ил. - Библиогр. в конце ст.
Кл.слова (ненормированные): ЛЕСНЫЕ ПОРОДЫ -- ХВОЙНЫЕ ПОРОДЫ -- НУКЛЕОТИДНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ -- ПОДВИЖНЫЕ ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ЭЛЕМЕНТЫ -- ДИАГНОСТИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ -- ИДЕНТИФИКАЦИЯ -- ГЕНОМЫ -- ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ -- ГЕНОМНЫЙ АНАЛИЗ -- МЕТОДЫ -- МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ -- ХРОМОСОМЫ -- ЛОКУСЫ -- БИОХИМИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ -- СЕКВЕНИРОВАНИЕ -- ДНК -- ДНК-БИБЛИОТЕКИ -- МЕТАБОЛИЗМ -- БИОРАЗНООБРАЗИЕ -- БИОЛОГИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА -- АДАПТИВНОСТЬ -- ИЗМЕНЧИВОСТЬ -- ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИЗМЕНЧИВОСТЬ -- СНГ -- БЕЛАРУСЬ Аннотация: Цель исследования - изучение разнообразия мобильных генетических элементов хвойных растений. Молекулярно-генетическая идентификация этих последовательностей в растительном геноме осуществлялась по результатам высокопроизводительного секвенирования на основе полупроводниковой детекции протонов (технология Ion Torrent). Поиск среди полученных протяженных последовательностей проводился путем сопоставления с записями базы данных GenBank NCBI. Было аннотировано 86 последовательностей, имеющих сходство с мобильными генетическими элементами I класса. Среди них - ретротраспозоны групп Ту3/gypsy и Ty1/copia, содержащие длинные концевые повторы (LTR) и широко встречающиеся в геноме ели и сосны, а также ретроэлементы семейства LINE, не содержащие LTR. При этом все обнаруженные последовательности были уникальными, а большая их часть содержала участки различных генов первичного и вторичного метаболизма хвойных, что может косвенно свидетельствовать об их роли в формировании адаптивной изменчивости растений. Доп.точки доступа: Рубель, И. Э.; Баранов, О. Ю.; Пантелеев, С. В.; Гущин, В. А.; Макаров, В. В.; Национальная академия наук Беларуси; Институт леса Имеются экземпляры в отделах: всего 1 : ОКД/630* (1) Свободны: ОКД/630* (1) |