Вид документа : Статья из журнала Шифр издания : Автор(ы) : Кипень В. Н., Михайлова М. Е., Снытков Е. В., Романишко Е. Л., Иванова Е. В., Шейко, Руслан Иванович Заглавие : Биоинформатический анализ геномов коммерческих пород домашних свиней для идентификации породоспецифичных SNP Место публикации : Весці Нацыянальнай акадэміі навук Беларусі. Серыя аграрных навук/ Нацыянальная акадэмія навук Беларусі. - Минск: Беларуская навука, 2021. - Т. 59, № 4. - С. 464-476: табл. - ISSN 1817-7204 (Шифр В1/2021/59/4). - ISSN 1817-7204 Примечания : Библиогр. в конце ст. УДК : 636.4.082.12 + 577.21 Ключевые слова (''Своб.индексиров.''): свиньи--с-х животные--породы свиней--чистопородные животные--породы животных--генофонд--генетические ресурсы--селекция--породность--контроль--генетика популяций--генетика--геномный анализ--генетический анализ--молекулярно-генетические методы--методы--snp--полиморфизм--полиморфизм одиночных нуклеотидов--идентификация--диагностические методы--специфичность--свойства--биоинформатика--информатика--племенная ценность--хозяйственно полезные признаки--оценка--беларусь--страны мира--21-50 Аннотация: Определение чистопородности сельскохозяйственных животных в селекционной системе имеет ключевое значение для всей отрасли животноводства. Чистопородное разведение заводских пород призвано обеспечить производство высокоценного улучшающего племенного материала для товарного животноводства. Определение чистопородности свиней может быть проведено с использованием однонуклеотидных полиморфизмов (SNP). Технология мультиплексирования сегодня достигла уровня, который позволяет за один запуск прибора охарактеризовать десятки и сотни тысяч полиморфных вариантов одновременно для сотен животных. Впервые с использованием методов биоинформатики проведен анализ полногеномных проектов для 264 особей вида Sus scrofa, расположенных в базе Sequence Read Archive (NCBI-SRA). Определен in silico генотип для 692 SNP, из которых для 59 SNP показан значительный потенциал для дифференциации четырех коммерческих пород: крупная белая (наиболее значимые SNP – Chr.6:g.85845403TG и Chr.16:g.74053569TC), дюрок (Chr.4:g.55661608AG, Chr.14:g.107689091TC и Chr.14:g.107939105TC), ландрас (Chr.5:g.99925204AG, Chr.18:g.40100481AG и Chr.18:g.7664624AG) и пьетрен (Chr.13:g.136017764TC и Chr.17:g.47595840AG). Для пород свиней дюрок и пьетрен точность дифференциации была не менее 99 %, для пород свиней крупная белая и ландрас - более 80 %, однако показатель чувствительности, характеризующий процент ложноположительных результатов классификации был немногим более 65 %. Создание моделей для молекулярно-генетических исследований данных пород позволит проводить генетическую экспертизу их чистопородности, что будет способствовать возрастанию их племенной ценности и сохранению национального генофонда. Доп.точки доступа: Кипень, В. Н.; Михайлова, М. Е.; Снытков, Е. В.; Романишко, Е. Л.; Иванова, Е. В.; Шейко, Руслан Иванович (член-корреспондент Национальной академии наук Беларуси ; род. 1973) |