Вид документа : Статья из журнала Шифр издания : 636.4.082.12/Д 50 Автор(ы) : Кипень В. Н., Снытков Е. В., Михайлова М. Е., Шейко, Руслан Иванович Заглавие : Дифференциация пород домашних свиней с использованием расширенного биоинформатического анализа SNP Место публикации : Доклады Национальной академии наук Беларуси/ Национальная академия наук Беларуси. - Минск: Беларуская навука, 2022. - Т. 66, № 3. - С. 301-309: табл. - ISSN 1561-8323 (print)ISSN 2524-2431 (online) (Шифр Д980924201152/2022/66/3). - ISSN 1561-8323 (print)ISSN 2524-2431 (online). - ISSN 1561-8323 (print)ISSN 2524-2431 (online) Примечания : Библиогр. в конце ст. УДК : 636.4.082.12 + (476) Ключевые слова (''Своб.индексиров.''): свиньи--с-х животные--селекция--породы свиней--дифференциация--чистопородные животные--биоинформатика--информатика--генетические маркеры--геномы--секвенирование--биохимические методы--snp--полиморфизм--генотипы--аллели--гены--генетический анализ--генетика--беларусь--страны мира--22-28 Аннотация: С использованием методов биоинформатики проведен анализ данных по секвенированию геномов особей вида Sus scrofa domesticus, которые расположены в базе Sequence Read Archive (NCBI-SRA). Определены in silico генотипы для пяти пород домашних свиней - дюрок, ландрас, пьетрен, крупная белая и йоркшир с помощью алгоритма, разработанного на языке программирования Python. На основании двухстадийного биоинформатического анализа определен широкий перечень SNP c высоким потенциалом для дифференциации. Полученные результаты будут использованы при создании экспресс-методов для определения чистопородности свиней данных пород. Расширенный биоинформатический анализ, который включал в себя определение генотипа по 7451 SNP для 248 геномов Sus scrofa domesticus, позволил выявить суммарно 393 SNP для всех пород, для которых имеется существенная разница в частоте альтернативных аллелей у пород свиней дюрок, ландрас, пьетрен, крупная белая и йоркшир. Обозначены кластеры в пределах хромосом, в которых плотность SNP с высоким дифференцирующим потенциалом наиболее высока. Для свиней породы дюрок нами выявлены 184 SNP, имеющие дифференцирующий потенциал, для 24 из которых показан высокий дифференцирующий потенциал, для свиней породы ландрас - 52 SNP и 7, для свиней породы пьетрен - 39 и 9, для свиней породы крупная белая - 104 и 22, для свиней породы йоркшир - 14 и 5 соответственно. Доп.точки доступа: Кипень, В. Н.; Снытков, Е. В.; Михайлова, М. Е.; Шейко, Руслан Иванович (член-корреспондент Национальной академии наук Беларуси ; род. 1973)