Вид документа : Однотомное издание Шифр издания : 618642 Автор(ы) : Веллер Дж. И. Заглавие : Геномная селекция животных Выходные данные : Санкт-Петербург: Проспект науки, 2018 Колич.характеристики :207 с.: рис., табл. Примечания : Библиогр.: с. 188-198. - Приложения: с. 199-207 ISBN, Цена 978-0-470-96007-3 (англ.): 129.36 р. ISBN, Цена 978-5-906106-58-3 (рус.): Б.ц. УДК : 636.082.2 Ключевые слова (''Своб.индексиров.''): с-х животные--крс--селекция--маркер-вспомогательная селекция--методы селекции--геномы--молекулярная генетика--генетика--локусы--локусы количественных признаков--морфологические маркеры--биохимические маркеры--генетические маркеры--rflp--snp--полиморфизм--изменчивость--генетическая изменчивость--генотипы--оценка--методы оценки--хозяйственно полезные признаки--племенная ценность--молекулярно-генетические методы--qtl-анализ--генетический анализ--геномный анализ--признаки--количественные признаки--исследования--экспериментальные исследования Содержание : ИСТОРИЧЕСКИЙ ОБЗОР ; Менделевская теория генетики ; Менделевская основа количественной вариации ; Выявление QTL с помощью морфологических и биохимических маркеров ; ДНК-маркеры, 1974-1994 гг. ; Развитие ДНК-маркеров, начиная с 1995 года: SNP и CNV ; Выявление QTL до появления геномной селекции ; MAS (marker-assisted selection) до появления геномной селекции ; ТИПЫ СОВРЕМЕННЫХ ГЕНЕТИЧЕСКИХ МАРКЕРОВ И МЕТОДОЛОГИИ ГЕНОТИПИРОВАНИЯ ; От биохимических маркеров до ДНК-маркеров ; Микросателлиты ДНК ; Однонуклеотидные полиморфизмы ; Вариация числа копий ; Полное секвенирование генома ; ПЕРЕДОВЫЕ ПРОГРАММЫ РАЗВЕДЕНИЯ ЖИВОТНЫХ ДО ПОЯВЛЕНИЯ ГЕНОМНОЙ СЕЛЕКЦИИ ; Внутрипородная селекция: основные принципы и уравнения ; Традиционные схемы селекции для молочного скота ; Схемы межпородного скрещивания: преимущества и недостатки ; ЭКОНОМИЧЕСКАЯ ОЦЕНКА ГЕНЕТИЧЕСКИХ СЕЛЕКЦИОННЫХ ПРОГРАММ ; Национальная экономика и конкуренция между селекционерами ; Критерии экономической оценки: горизонт прибыли, процентная ставка и доходность инвестиций ; НАИМЕНЬШИЕ КВАДРАТЫ, МАКСИМАЛЬНОЕ ПРАВДОПОДОБИЕ И БАЙЕСОВСКАЯ ОЦЕНКА ПАРАМЕТРОВ ; Оценка параметров методом наименьших квадратов ; Оценка МП для одного параметра ; Многопараметрическая оценка МП ; Методы максимизации функций правдоподобия ; Доверительные интервалы и тестирование гипотез для MLE ; Байесовская оценка ; Оценка параметров с помощью сэмплирования по Гиббсу ; ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ОЦЕНКА НА ОСНОВЕ ПРИЗНАКОВ: СМЕШАННАЯ МОДЕЛЬ ; Принципы селекционного индекса ; Смешанная линейная модель ; Уравнения смешанной модели (УСМ) ; Решение уравнений смешанной модели (УСМ) ; Важные свойства решений УСМ ; Многомерный анализ смешанной модели ; Модель отдельной особи ; Отклонение продуктивности (YD) и отклонение продуктивности дочерей (DYD) ; Анализ DYD в качестве зависимой переменной ; МАКСИМАЛЬНОЕ ПРАВДОПОДОБИЕ И БАЙЕСОВСКАЯ ОЦЕНКА ПАРАМЕТРОВ QTL С ВКЛЮЧЕНИЕМ СЛУЧАЙНЫХ ЭФФЕКТОВ В МОДЕЛЬ ; Оценка максимального правдоподобия эффектов QTL с включением случайных эффектов в модель, схема дочери ; Схема внучки ; Определение априорных распределений параметров QTL для схемы внучки ; Формула для байесовской оценки и проверки значимости сегрегирующего QTL в схеме внучки ; МАКСИМАЛЬНОЕ ПРАВДОПОДОБИЕ, ОГРАНИЧЕННОЕ МАКСИМАЛЬНОЕ ПРАВДОПОДОБИЕ И БАЙЕСОВСКОЕ ОЦЕНИВАНИЕ ДЛЯ СМЕШАННЫХ МОДЕЛЕЙ ; Вывод решений уравнений смешанной модели с максимальным правдоподобием ; Оценка компонентов дисперсии смешанной модели ; Оценка максимального правдоподобия КД ; Оценка КД методом ограниченного максимального правдоподобия ; Оценка КД с помощью сэмплирования Гиббса ; РАСПРЕДЕЛЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ЭФФЕКТОВ, ТЕОРИЯ И РЕЗУЛЬТАТЫ ; Моделирование полигенной дисперсии ; Эффективное число QTL ; Случай «утерянной наследственности» ; Методы определения причинных мутаций для QTL у животных и людей ; Определение QTN у молочного скота ; Оценка числа сегрегирующего QTL на основе исследований картирования сцеплений ; Результаты сканирования генома молочного скота по схеме внучки ; Результаты исследования общегеномных ассоциаций у молочного скота с помощью SNP-чипов ; ПРОБЛЕМА МНОЖЕСТВЕННОГО СРАВНЕНИЯ ; Множественные маркеры и полногеномное сканирование ; Обнаружение QTL с помощью перестановочных тестов ; Обнаружение QTL на основе частоты ложного обнаружения ; Априорное определение доли ложных положительных тестов ; Смещение в оценке множественных QTL ; Байесовская оценка QTL на основе полногеномного сканирования: теория ; Байесовские модели А и В ; Байесовская оценка QTL на основе полногеномного сканирования: результаты моделирования ; КАРТИРОВАНИЕ С ПОМОЩЬЮ СЦЕПЛЕНИЙ QTL ; Интервальное картирование с помощью нелинейной регрессии: схема обратного скрещивания ; Интервальное картирование для схемы дочери и внучки ; Вычисление доверительных интервалов ; Модельные исследования CI ; Эмпирические методы оценки CI, методы параметрического и непараметрического бутстрэпа и метод «складного ножа» ; КАРТИРОВАНИЕ QTL С ПОМОЩЬЮ НЕРАВНОВЕСНОГО СЦЕПЛЕНИЯ ; Оценка неравновесного сцепления в популяциях животных ; Картирование QTL с помощью LD: основные принципы ; Объединенное картирование сцеплением и LD ; LD картирование множества признаков и множества QTL ; МАРКЕР-ОРИЕНТИРОВАННАЯ СЕЛЕКЦИЯ: ОСНОВНЫЕ СТРАТЕГИИ ; Ситуации, в которых селекционный индекс неэффективен ; Потенциальный вклад MAS во внутрипородную селекцию: общие вопросы ; Фенотипический отбор в сравнении с MAS для индивидуального отбора ; MAS для признаков, связанных с полом ; MAS с маркерной фенотипической информацией о родственниках ; Максимальная эффективность MAS при всех известных QTL в отношении селекции на основе признаков и снижение RSE в связи с вариантностью выборки ; Информация о маркерах в сегрегирующих популяциях ; Выключение информации о маркерах в генетические оценки "модели животных" ; Прогнозируемые генетические тренды при GEBY: результаты моделирования ; ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ОЦЕНКА НА ОСНОВЕ ПЛОТНЫХ МАРКЕРНЫХ КАРТ: ОСНОВНЫЕ СТРАТЕГИИ ; Основные этапы геномной оценки ; Оценка точности GEBY ; Источники смещения в геномной оценке ; Являются ли маркерные эффекты фиксированными или случайными? ; Отдельные маркеры или гаплотипы ; Количество маркеров, пригодных для использования, в сравнении с общим числом маркеров ; Отклонение частот генотипа от их ожиданий ; Включение всех маркеров в сравнении с отбором маркеров с существенными эффектами ; Матрица геномных отношений ; ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ОЦЕНКА, ОСНОВАННАЯ НА АНАЛИЗЕ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ОЦЕНОК ИЛИ ОЦЕНОК С ПОМОЩЬЮ DYD ; Сравнение одношаговых и многошаговых моделей ; Вывод и свойства отклонения продуктивности дочери и DYD ; Вычисление "дерегрессированных" генетических оценок ; Анализ DYD как зависимой переменной со всеми маркерами, включенными в качестве случайных эффектов ; Вычисление достоверности GEBV ; Байесовское взвешивание маркерных эффектов ; Дополнительные байесовские методы геномной оценки ; ГЕНОМНАЯ ОЦЕНКА НА ОСНОВЕ АНАЛИЗА ЗАПИСЕЙ ПРОДУКТИВНОСТИ ; Одношаговые методологии: базовая стратегия ; Вычисление модифицированной матрицы отношений, когда только часть животных генотипирована: проблема ; Критерии для допустимых матриц генетических отношений ; Вычисление модифицированной матрицы отношений, когда только часть животных генотипирована: решение ; Решение УСМ без инвертирования матрицы H ; Инвертирование матрицы геномных отношений ; Оценка надежности значений геномной племенной ценности, полученных одношаговыми методами ; Одношаговое вычисление геномных оценок с использованием неодинаково взвешенных маркерных эффектов ; ВАЛИДАЦИЯ МЕТОДИК ГЕНОМНЫХ ОЦЕНОК ПЛЕМЕННОЙ ЦЕННОСТИ ; Критерии качественной оценки прогноза племенной ценности ; Методы, используемые для проверки геномных генетических показателей ; Оценка двухшаговой методологии на основе смоделированных данных по молочному скоту ; Оценка многошаговой методологии на основе фактических данных по молочному скоту ; Оценка одношаговых методологий на основе фактических данных по молочному скоту ; Оценка одно- и многошаговых методологий, основанных на фактических данных по птице ; Оценка одно- и многошаговых методов на основе фактических данных по свиньям ; Оценка GEBV для растений на основе фактических данных ; ПОБОЧНЫЕ РЕЗУЛЬТАТЫ ГЕНОМНОГО АНАЛИЗА: ПРОВЕРКА И ОПРЕДЕЛЕНИЕ РОДОСЛОВНОЙ ; Влияние неверной идентификации родителя на программы разведения ; Принципы проверки и определения родословной с помощью генетических маркеров ; Подтверждение отцовства до появления SNP-чипов высокой плотности ; Подтверждение отцовства после появления SNP-чипов ; Проверка более отдаленных родственных связей ; Реконструкция родословной при помощи генетических маркеров высокой плотности ; ИМПУТАЦИЯ ОТСУТСТВУЮЩИХ ГЕНОТИПОВ: МЕТОДОЛОГИИ, ТОЧНОСТЬ И ВЛИЯНИЕ НА ГЕНОМНЫЕ ОЦЕНКИ ; Выявление гаплотипов для импутации ; Импутация у людей и сельскохозяйственных животных ; Алгоритмы импутации в популяциях людей и животных ; Сравнение точности и скорости методов импутации ; Влияние импутации на геномные генетические оценки ; ОБНАРУЖЕНИЕ И ПОДТВЕРЖДЕНИЕ НУКЛЕОТИДОВ КОЛИЧЕСТВЕННЫХ ПРИЗНАКОВ ; GWAS по экономически важным признакам у коммерческих видов животных ; Обнаружение QTN: стоит ли оно наших усилий? ; Обнаружение QTN у сельскохозяйственных животных: что является доказательством? ; Конкордантность между генотипами ДНК и статусом QTL ; Определение конкордантности по схеме APGD ; Выявление фазы у гетерозиготных дедов по QTL ; Выявление рецессивных деталей с помощью GWAS и эффекты, связанные с гетерозиготами ; Проверка QTN при помощи статистических и биологических методов ; ДАЛЬНЕЙШИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ И ВЫВОДЫ ; Больше маркеров или больше особей с генотипами ; Вычисление геномных оценок для коров и телят ; Совершенствование методов геномной оценки ; Досрочные выводы ; Взвешивание оценок старых и молодых быков ; Прямая генетическая манипуляция у сельскохозяйственных животных ; Велогенетика: синергетическое использование MAS и манипуляции с зародышевым путем Аннотация: Перевод с английского языка монографии ведущего ученого Института зоологии Центра сельскохозяйственных исследований (Бет-Даган, Израиль). Описана геномная селекция, основанная на синтезе статистической и молекулярной генетик. Рассмотрены ранние эксперименты по выявлению локусов количественных признаков (QTL) при помощи морфологических и биохимических маркеров, начиная со знакового эксперимента Сакса с фасолью (Phaseolusvulgaris), развитие ДНК-маркеров, начиная с полиморфизмов длин рестрикционных фрагментов (RFLP) до однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) и вариаций числа копий (CNV), обнаружение QTL и маркеропосредованная/ориентированная селекция (MAS) до возникновения геномной селекции. Экземпляры :ОКД/636/618642(1) Свободны : ОКД/636/618642(1) Доп.точки доступа: Племяшов, К. В. \ред.\