Вид документа : Однотомное издание Шифр издания : 610908 Автор(ы) : Ребриков Д. В., Саматов Г. А., Трофимов Д. Ю., Семенов П. А., Савилова А. М., Кофиади И. А., Абрамов Д. Д. Заглавие : ПЦР в реальном времени . -6-е изд Выходные данные : Москва: БИНОМ. Лаборатория знаний, 2014 Колич.характеристики :223 с.: рис., табл. Примечания : Предм. указ.: с. 216-223 ISBN, Цена 978-5-9963-1898-8: 168000 р. УДК : 577.21 Ключевые слова (''Своб.индексиров.''): pcr--молекулярно-генетические методы--оборудование--анализ данных Содержание : ЧТО ТАКОЕ ПЦР ; Изобретение ПЦР ; Изобретение ПЦР "в реальном времени" ; Отличие анализа продуктов ПЦР "по конечной точке" и "в реальном времени" ; Развитие ПЦР "в реальном времени" как диагностического инструмента ; ОСНОВЫ ПОЛИМЕРАЗНОЙ ЦЕПНОЙ РЕАКЦИИ ; Общие сведения о ПЦР ; Организация ПЦР-лаборатории ; Оборудование и материалы для ПЦР ; Свойства олигонуклеотидов (праймеров и проб) ; Влияние ионов Mg2+ ; Свободные дезоксирибонуклеотидтрифосфаты (dNTPs) ; Влияние рН ; Минеральное масло ; Другие компоненты, добавление которых влияет на ПЦР ; Ферменты, используемые в ПЦР ; Программы амплификации ; "Горячий старт" (hot start) ; ОБОРУДОВАНИЕ ДЛЯ ПЦР "В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ" ; Устройство детектирующих амплификаторов ; Основные функциональные узлы ; Обзор характерных разновидностей приборов ; Тенденции развития оборудования для ПЦР "в реальном времени" ; ВИЗУАЛИЗАЦИЯ НАКОПЛЕНИЯ ДНК ПРИ ПРОВЕДЕНИИ ПЦР "В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ" ; Флуоресценция ; Флуорофоры ; Гасители флуоресценции ; Неспецифичные системы детекции ; Специфичные системы детекции ; ДИЗАЙН ПРАЙМЕРОВ И ПРОБ, ПРОГРАММЫ АМПЛИФИКАЦИИ ; Параметры, влияющие на взаимодействие олигонуклеотида и ДНК ; Выбор последовательности проб ; Программное обеспечение для дизайна праймеров и проб ; Особенности систем праймеры-проба ; Особенности программ амплификации для ПЦР "в реальном времени" ; ОСОБЕННОСТИ ОЧИСТКИ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ ДЛЯ ПЦР "В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ" ; Общие принципы очистки нуклеиновых кислот для использования в ПЦР ; Особенности взятия биоматериала для клинических ПЦР-исследований и риск контаминации ; Особенности методов очистки НК для ПЦР "в реальном времени" ; Типовые ошибки использования ПЦР "в реальном времени", связанные с количеством нуклеиновых кислот, забираемых в реакцию ; АНАЛИЗ ДАННЫХ ПЦР "В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ" ; Методы и средства анализа графиков накопления ДНК ; Простая модель ПЦР ; Связь флуоресцентного сигнала и накопления ДНК в ходе ПЦР ; Пороговый метод сравнения графиков накопления ДНК (Ct) ; Определение эффективности ПЦР ; Недостатки порогового метода и пути их преодоления ; Методы прямого сравнения графиков накопления ДНК (Cp) ; Комбинация методов Ct и Ср ; ОПРЕДЕЛЕНИЕ УРОВНЯ ПРЕДСТАВЛЕННОСТИ ТРАНСКРИПТОВ ; Организация эксперимента ; Абсолютное определение уровня представленности транскриптов ; Относительное определение уровня представленности транскриптов ; Нормировка данных ; Внутренний контрольный образец ; Отрицательный контрольный образец ; КОЛИЧЕСТВЕННОЕ ОПРЕДЕЛЕНИЕ ВИРУСНОЙ НАГРУЗКИ ; Количественное определение вирусной нагрузки ; Источники погрешностей и варианты учета потерь и эффективности реакции ; ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ПЦР "В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ" ДЛЯ ОПРЕДЕЛЕНИЯ ОДНОНУКЛЕОТИДНОГО ПОЛИМОРФИЗМА ; Однонуклеотидный полиморфизм последовательностей ДНК ; Идентификация ОНП с помощью аллель-специфичных праймеров ; Дифференциация аллелей с помощью олигонуклеотидных проб ; Генотипирование ОНП методом плавления ДНК-дуплексов ; ОПРЕДЕЛЕНИЕ ОТНОСИТЕЛЬНОГО СОДЕРЖАНИЯ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ НА ПРИМЕРЕ ГЕНЕТИЧЕСКИ МОДИФИЦИРОВАННЫХ ИСТОЧНИКОВ ; Общие сведения о ГМИ ; Классификация существующих методов определения ГМИ в продуктах питания ; Организация чужеродной ДНК в геноме растений ; Выбор последовательностей-мишеней для выявления чужеродной ДНК в геноме растения ; Тест-системы для определения процентного содержания чужеродной ДНК относительно геномной ДНК растений ; Выбор чужеродной и нормированной ДНК для количественного определения ГМИ ; Калибровочные образцы ; Точность метода определения процентного содержания генетически модифицированных ингредиентов в пище с помощью метода ПЦР "в реальном времени" Аннотация: Рассмотрены различные варианты и особенности оборудования для проведения ПЦР "в реальном времени", даны рекомендации по выбору амплификатора. Разобраны особенности систем флуоресцентной регистрации накопления ДНК. Рассмотрены ключевые факторы, определяющие выбор последовательности олигонуклеотидов и параметры программ амплификации. Уделено внимание подготовке проб и особенностям анализа получаемых данных, что необходимо для получения наиболее достоверных результатов. Отдельные главы посвящены применению ПЦР "в реальном времени" для решения различных задач: определения уровня представленности транскриптов, вирусной нагрузки, нуклеотидного полиморфизма, относительного содержания нуклеиновых кислот на примере ГМО. Экземпляры :ОКД/57/610908(1) Свободны : ОКД/57/610908(1) Доп.точки доступа: Ребриков, Д. В.; Саматов, Г. А.; Трофимов, Д. Ю.; Семенов, П. А.; Савилова, А. М.; Кофиади, И. А.; Абрамов, Д. Д.; Ребриков, Д. В. \ред.\