Д 50 Дифференциация пород домашних свиней с использованием расширенного биоинформатического анализа SNP / В. Н. Кипень [и др.] // Доклады Национальной академии наук Беларуси = Doklady of the National akademy of sciences of Belarus. - 2022. - Т. 66, № 3. - С. 301-309 : табл. - Библиогр. в конце ст. . - ISSN 1561-8323. - ISSN 2524-2431
Кл.слова (ненормированные): СВИНЬИ -- С-Х ЖИВОТНЫЕ -- СЕЛЕКЦИЯ -- ПОРОДЫ СВИНЕЙ -- ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ -- ЧИСТОПОРОДНЫЕ ЖИВОТНЫЕ -- БИОИНФОРМАТИКА -- ИНФОРМАТИКА -- ГЕНЕТИЧЕСКИЕ МАРКЕРЫ -- ГЕНОМЫ -- СЕКВЕНИРОВАНИЕ -- БИОХИМИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ -- SNP -- ПОЛИМОРФИЗМ -- ГЕНОТИПЫ -- АЛЛЕЛИ -- ГЕНЫ -- ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ -- ГЕНЕТИКА -- БЕЛАРУСЬ -- СТРАНЫ МИРА -- 22-28 Аннотация: С использованием методов биоинформатики проведен анализ данных по секвенированию геномов особей вида Sus scrofa domesticus, которые расположены в базе Sequence Read Archive (NCBI-SRA). Определены in silico генотипы для пяти пород домашних свиней - дюрок, ландрас, пьетрен, крупная белая и йоркшир с помощью алгоритма, разработанного на языке программирования Python. На основании двухстадийного биоинформатического анализа определен широкий перечень SNP c высоким потенциалом для дифференциации. Полученные результаты будут использованы при создании экспресс-методов для определения чистопородности свиней данных пород. Расширенный биоинформатический анализ, который включал в себя определение генотипа по 7451 SNP для 248 геномов Sus scrofa domesticus, позволил выявить суммарно 393 SNP для всех пород, для которых имеется существенная разница в частоте альтернативных аллелей у пород свиней дюрок, ландрас, пьетрен, крупная белая и йоркшир. Обозначены кластеры в пределах хромосом, в которых плотность SNP с высоким дифференцирующим потенциалом наиболее высока. Для свиней породы дюрок нами выявлены 184 SNP, имеющие дифференцирующий потенциал, для 24 из которых показан высокий дифференцирующий потенциал, для свиней породы ландрас - 52 SNP и 7, для свиней породы пьетрен - 39 и 9, для свиней породы крупная белая - 104 и 22, для свиней породы йоркшир - 14 и 5 соответственно. Доп.точки доступа: Кипень, В. Н.; Снытков, Е. В.; Михайлова, М. Е.; Шейко, Руслан Иванович (член-корреспондент Национальной академии наук Беларуси ; род. 1973) Имеются экземпляры в отделах: всего 1 : ОКД (1) Свободны: ОКД (1) |